Die Biologische Station Lippe wird von einem gemeinnützigen Verein getragen. 

Mitglieder des Trägervereins sind:

1. Vorsitzender ist seit dem 15.12.2009 Bernd Milde (Naturschutzbund Deutschland-Kreisverband Lippe e.V.). Vorgänger war Prof. Dr. Jürgen Döhl (Naturwissenschaftlicher und Historischer Verein für das Land Lippe e.V.), der dieses Amt von 1992 bis zum Jahr 2009 inne hatte. 

Stellvertretende Vorsitzende sind Dr. Ute Röder (Kreis Lippe) und Georg Kramer (Lippischer Heimatbund).

Geschäftsführer ist seit dem Jahreswechsel 2008/2009 Matthias Füller, bis dahin wissenschaftlicher Angestellter des Vereines.